Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms