Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP3P10745 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP3P10745 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP3P10745 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP3P10745 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP3P10745 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP3P10745 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP3P10745 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP3P10745 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP3P10745 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP3P10745 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP3P10745 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP3P10745 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP3P10745 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP3P10745 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP3P10745 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP3P10745 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms