Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGB3P0DN86 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms