Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms