Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SP9P0CG40 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SP9P0CG40 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms