Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT7P08729 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT7P08729 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT7P08729 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT7P08729 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT7P08729 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT7P08729 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT7P08729 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT7P08729 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT7P08729 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT7P08729 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT7P08729 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms