Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCCAP05165 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCCAP05165 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCCAP05165 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PCCAP05165 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCCAP05165 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCCAP05165 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCCAP05165 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCCAP05165 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCCAP05165 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCCAP05165 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCCAP05165 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCCAP05165 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCCAP05165 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCCAP05165 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCCAP05165 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCCAP05165 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PCCAP05165 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCCAP05165 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCCAP05165 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCCAP05165 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PCCAP05165 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms