Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN1P04843 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN1P04843 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN1P04843 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPN1P04843 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN1P04843 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN1P04843 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN1P04843 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN1P04843 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN1P04843 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN1P04843 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN1P04843 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN1P04843 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN1P04843 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN1P04843 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms