Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNB1P01574 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms