Protein–RNA interactions for Protein: O95782

AP2A1, AP-2 complex subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2A1O95782 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms