Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNTO95613 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNTO95613 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNTO95613 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNTO95613 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNTO95613 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNTO95613 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCNTO95613 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNTO95613 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNTO95613 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNTO95613 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNTO95613 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNTO95613 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNTO95613 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNTO95613 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNTO95613 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNTO95613 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms