Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF12O95522 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms