Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms