Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9AO75110 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms