Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOL3O60936 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOL3O60936 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOL3O60936 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOL3O60936 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOL3O60936 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOL3O60936 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NOL3O60936 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOL3O60936 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NOL3O60936 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NOL3O60936 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOL3O60936 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOL3O60936 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOL3O60936 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOL3O60936 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOL3O60936 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOL3O60936 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOL3O60936 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms