Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK2O60296 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms