Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN4O43707 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN4O43707 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms