Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms