Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COCHO43405 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COCHO43405 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COCHO43405 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COCHO43405 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COCHO43405 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COCHO43405 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COCHO43405 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COCHO43405 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COCHO43405 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COCHO43405 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COCHO43405 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COCHO43405 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COCHO43405 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COCHO43405 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COCHO43405 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COCHO43405 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COCHO43405 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COCHO43405 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COCHO43405 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COCHO43405 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COCHO43405 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COCHO43405 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COCHO43405 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms