Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAP3K13O43283 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms