Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNPATO15228 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNPATO15228 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNPATO15228 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNPATO15228 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNPATO15228 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNPATO15228 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
GNPATO15228 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPATO15228 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPATO15228 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPATO15228 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPATO15228 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPATO15228 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPATO15228 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPATO15228 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPATO15228 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPATO15228 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPATO15228 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPATO15228 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPATO15228 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPATO15228 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPATO15228 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPATO15228 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPATO15228 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPATO15228 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPATO15228 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPATO15228 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPATO15228 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPATO15228 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPATO15228 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPATO15228 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPATO15228 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPATO15228 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPATO15228 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPATO15228 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPATO15228 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNPATO15228 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNPATO15228 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNPATO15228 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNPATO15228 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms