Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC27A2O14975 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms