Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBKBO14920 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms