Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC80O14777 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC80O14777 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC80O14777 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC80O14777 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC80O14777 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC80O14777 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC80O14777 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC80O14777 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC80O14777 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC80O14777 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC80O14777 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC80O14777 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC80O14777 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC80O14777 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms