Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLRMTO00411 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
POLRMTO00411 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms