Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EIF3FO00303 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms