Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARVCFO00192 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARVCFO00192 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms