Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNAP23O00161 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAP23O00161 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms