Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN8O00124 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms