Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms