Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BQV1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BQV1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BQV1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BQV1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BQV1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BQV1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BQV1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BQV1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BQV1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BQV1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BQV1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQV1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQV1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
H3BQV1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQV1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQV1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms