Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms