Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PALM3A6NDB9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms