Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms