Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD3A2A2Y4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms