Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms