Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 NUTM2A-201ENST00000381689 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CCDC175-202ENST00000537690 2616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZNF423-205ENST00000562871 4514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ALDH3A2-203ENST00000395575 3640 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CDK10-201ENST00000331006 3344 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TMEM255A-204ENST00000440464 3172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GOLM1-202ENST00000388711 3022 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ANKEF1-202ENST00000378392 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TYRO3P-201ENST00000558165 2705 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL512378.1-201ENST00000394808 2100 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AIPL1-203ENST00000381129 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PHACTR3-201ENST00000355648 2247 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SCML4-202ENST00000369021 2056 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 POM121L1P-201ENST00000402027 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZNF648-201ENST00000339948 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DUSP27-203ENST00000443333 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GRAMD1B-201ENST00000322282 2571 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ARHGAP36-206ENST00000639280 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LMCD1-AS1-201ENST00000420095 2144 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PCDHGB5-201ENST00000617380 4578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DPY19L2P1-202ENST00000454445 2909 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC113391.1-201ENST00000507236 578 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 M1AP-202ENST00000409585 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CHST9-201ENST00000580774 2033 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 POTEE-205ENST00000626191 2027 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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