Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RN7SKP170-201ENST00000362550 328 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 MIR219A2-202ENST00000385220 97 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RN7SL186P-201ENST00000466485 297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RN7SL386P-201ENST00000485776 297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AP000812.3-201ENST00000544535 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC092329.1-201ENST00000594653 574 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL078590.3-201ENST00000607531 750 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC095350.1-201ENST00000443685 1711 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC010148.1-203ENST00000413842 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PGAM1P4-201ENST00000397343 750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC005587.1-201ENST00000401879 592 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SLC16A14P1-201ENST00000506846 1117 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MRPS27-212ENST00000522095 504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC092295.2-201ENST00000592087 1392 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ANXA13-202ENST00000419625 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RPL30-201ENST00000287038 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL353747.1-201ENST00000404577 267 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PGAM1P7-201ENST00000413837 737 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC006022.1-201ENST00000425261 388 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LINC01442-202ENST00000618872 1600 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LINC00355-201ENST00000456627 1878 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ZNF155-207ENST00000590615 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC073263.2-201ENST00000624835 1863 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms