Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 NKIRAS2-205ENST00000393881 1598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 CLEC17A-203ENST00000547437 2065 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 CHI3L2-201ENST00000369744 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 KRT8P15-201ENST00000425226 1451 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCAP28676 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AK7-201ENST00000267584 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 ZNF530-201ENST00000332854 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 MASTL-201ENST00000342386 2968 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC023509.4-201ENST00000602306 775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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