Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 DENND2A-209ENST00000496613 3562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 CASP7-203ENST00000369318 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 KLK2-201ENST00000325321 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 CD300LF-202ENST00000326165 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GDF9-207ENST00000624495 1799 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC010624.1-201ENST00000527209 1525 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CXCL13-201ENST00000286758 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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