Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX11Q9Y5W9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms