Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms