Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms