Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms