Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms