Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDD3Q9Y3P4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDD3Q9Y3P4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDD3Q9Y3P4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDD3Q9Y3P4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDD3Q9Y3P4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDD3Q9Y3P4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDD3Q9Y3P4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms