Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ4Q9Y3A0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ4Q9Y3A0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ4Q9Y3A0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ4Q9Y3A0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ4Q9Y3A0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ4Q9Y3A0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ4Q9Y3A0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COQ4Q9Y3A0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COQ4Q9Y3A0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms