Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D4Q9Y2X8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms