Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINS2Q9Y248 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms