Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SRPK3Q9UPE1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRPK3Q9UPE1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms